東横線跡に埼京線ホーム 渋谷駅再開発、２６年度までに（朝日新聞デジタル）

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東京・渋谷駅のＪＲ埼京線のホームを、３月に地下に引っ越す東急東横線渋谷駅の跡地に移す方向でＪＲ東日本などが検討を進めていることが２３日、分かった。埼玉や神奈川方面から山手線への乗り換えが便利になる。新たに建設される駅ビルを含めた再開発工事は２０２６年度までに完了する見込みだ。

新宿駅もそうですが、貨物線だったところに後からホームを設置することになったため、既存のホーム付近にはスペースが無いので、ホーム一つ分ずれた場所に設置せざるを得ないということがあったようですね。
渋谷駅の場合は偶然にも東横線の付け替えで空き地ができたので移設できますが、新宿駅は不便なままなんでしょうね。